Bacteriile apar în fiecare habitat de pe pământ, în timp ce cianobacteriile apar mai ales în prezența soarelui și a umidității.
Bacteriile sunt mici, în timp ce cianobacteriile sunt relativ mari
Unele bacterii conțin flageli, în timp ce cianobacteriile nu au flagel. Prin urmare, unele bacterii sunt mobile, în timp ce cianobacteriile sunt imobile