- in cazul structurilor aciclice , izomeria cis-trans se stabileste in functie de pozitia unor substituienti fata de planul legaturii π;
- in cazul structurilor ciclice , .... fata de planul ciclului ;
ex. 1,2 dimetilciclohexan : izomerul cis are cele 2 grupe -CH3 situate de aceeasi parte a planului ciclului .... iar . trans...una de o parte si a doua de cealalta ;