1) Faţa lui intunecată începuse ¹/ să prindă pete albe. ²/
1 — propoziţia principala
2 — subordonata completiva directă [(începuse) ce?]
2) Nilă însă, de frică, se făcuse roşu ¹/ şi nu îndrăznea ²/ nici să mai mănânce. ³/
1 — propoziţie principala
2 — propozitie principala
3 — subordonata completiva directă [(nu indraznea) ce?]
3) Când, după cateva clipe, Moromete, uitându-se la el cu o privire intensă, îi explica: ¹/ →[intuiesc că dupa doua puncte ar trebui sa urmeze linia de dialog sau vorbirea directă între ghilimele]
Deci, daca ar fi si vorbirea directa, s-ar considera fraza completa...
Aici e o constructie gerunziala izolata de verbul "explica"